Il laboratorio top-secret di Los Alamos, nel New Mexico, aprì nell'aprile del 1943 con J. Robert Oppenheimer come direttore scientifico. Solo 27 mesi dopo, Oppenheimer e i suoi colleghi erano pronti a testare un'arma atomica. Tutti a Los Alamos in grado di avere un'opinione informata concordarono sul fatto che senza la straordinaria leadership di Oppenheimer, le bombe atomiche non sarebbero state completate in tempo per essere utilizzate durante la guerra. Era sia una questione di orgoglio che un pesante fardello per "il padre della bomba atomica".
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Un altro scienziato di Los Alamos ha ricordato che Oppenheimer "era presente nel laboratorio o nelle sale per seminari quando veniva misurato un nuovo effetto, quando era stata concepita una nuova idea ... La sua presenza continua e intensa ... ha prodotto un senso di partecipazione diretta a tutti noi."
Oppenheimer era presente anche quando colleghi scienziati hanno discusso dei potenziali usi della bomba. Alla fine del 1944, fu chiaro che la guerra in Europa sarebbe presto finita. Numerosi scienziati di Los Alamos hanno iniziato a esprimere i loro crescenti scrupoli etici sul continuo sviluppo del "gadget".
Oppenheimer sosteneva che la guerra non sarebbe finita senza che il mondo fosse a conoscenza di questa nuova arma primordiale. Se il gadget fosse rimasto un segreto militare, la prossima guerra sarebbe quasi certamente combattuta con armi atomiche e sarebbero stati utilizzati in un attacco a sorpresa. Gli scienziati hanno dovuto avanzare, ha spiegato, al punto che poteva almeno essere testato.